La historia de Manises como Aerodromo del Ejercito del Aire comenzó en el año 1.944, con la llegada de los F-86 Sabre cuando se convirtió en la cuna de la moderna aviación de combate.
En 1.959 se declaró al Ala de Caza nº 1 como continuadora de la tradición del Grupo de Caza de García Morato y heredera de su legado histórico.
El Ala contaba con 123 Sabres, operando con dos escuadrones el 11 y el 12, formándose el año 1.956 la patrulla acrobática Ascua que estuvo activa hasta el año 1.965 y es la antecesora de la actual patrulla Aguila.
El 1 de abril de 1.965 el Ala de Caza nº 1 se convierte en el Ala nº 11, transformándose el escuadrón 11 en el 111 y el escuadrón 12 en el 112. Hasta enero de 1.970 se hicieron en el F-86 141.000 horas de vuelo.
El día 12 de junio de 1.970 aterrizaban en Manises los primeros ocho aviones Mirage III adquiridos a Francia. El Mirage III era uno de los aviones de combate más avanzados de la época.
La entrega de aviones continuó hasta el 10 de octubre de 1.972, adquiriéndose en total 24 monoplazas y 6 biplazas. Con estos primeros aviones se formó el 101 Escuadrón, hasta la reorganización de mayo de 1.971 en el que pasa a denominarse 111 Escuadrón con su emblema de la hiena amordazada y el lema "Excrementa edit Iacet semel pro anno et Tamen Irridet"
En octubre del mismo año se crea el 112 Escuadrón con el lema "Que no valga".
El día 1 de octubre de 1.992 se despidieron de Valencia los Mirage III después de una fallida modernización que había empezado tres años antes (Defensa cancela la modernizacion de 23 cazas Mirage III).
Hasta esa fecha los Mirage III hicieron mas de 80.000 horas de vuelo. En su despedida participaron ocho Mirage III y aviones de otras unidades y los primeros Mirage F1 que se incorporaban al Ala 11.
El Jefe de Estado mayor había firmado la directiva 26/91 de 20-11-91 " CONTINUIDAD DEL ALA 11 Y B.A. MANISES AL PRODUCIRSE LA BAJA DEL C-11 (MIRAGE III" en la que se decía: El Ejército del Aire tiene previsto dar de baja en el año 1992 al sistema de armas Mirage III (C-11), avión de dotación del Ala 11, en la B.A. de Manises. Dado el interés militar que esta Base y su Unidad representan para los Planes Operativos del E.A. en función de las operaciones que en razón a los focos de riesgo se pudieran realizar en el área geográfica del Mediterráneo Occidental, se considera necesario mantener la operatividad militar en la citada B.A. de Manises y con la finalidad de: Mantener la actividad militar en la B.A. de Manises así como la continuidad del Ala 11 cuando se produzca la baja del sistema C-11, dotando a esta Unidad con un destacamento permanente de doce (12) C-14 del Ala 14, siendo las tripulaciones aéreas y el mantenimiento al nivel que se designe, del Ala 11.
Estos aviones permanentemente destacados en la B.A. de Manises, constituirían el Escuadrón con el que España iba a contribuir al Contingente Aéreo de las Fuerzas de Reacción inmediata (IRF) de las Fuerzas de Reacción de la OTAN.
Inicialmente se destinaron seis F-1 procedentes del Ala 14 (Albacete). Se empezó a trabajar en la organización del Escuadrón pero, debido a la escasez de aviones y de repuesto, se estaba empezando notar los dos años que se había dejado de comprar repuesto, la idea de formar el IRF se descartó.
El 31 de julio de 1999, se cerro la Base de Manises y con ella 55 años de historia.
DIRECTIVA NÚM. 33 DE 16 DE DICIEMBRE DE 1997, DEL JEFE DEL ESTADO MAYOR DEL EJÉRCITO DEL AIRE POR LA QUE SE DESACTIVA EL ALA 11 Y SE CIERRA LA BASE AÉREA DE MANISES
El Ejército del Aire se encuentra inmerso en proceso de adaptación de su estructura para poder dar respuesta a la cada vez mayores demandas de la Defensa Nacional, dentro de una coyuntura marcada por la escasez de recursos humanos, materiales y presupuestarios, que obligan a un esfuerzo de racionalización, que se traduce en la concentración de efectivos en las Bases Aéreas más adecuadas, con el fin de afrontar la escasez de personal y minimizar los costos de mantenimiento, tanto de los medios aéreos, como de la infraestructura de apoyo. Todo ello sin merma de la capacidad operativa del Ejército del Aire /../. A la vista de las conclusiones del estudio, de las políticas de gestión de personal, de recursos y presupuestaria, y tras valorar las implicaciones de carácter operativo, se considera necesaria la desactivación del Ala 11 y el cierre de la Base de Manises medida orientada a producir un efecto multiplicador en la eficacia operativa del Ejército del Aire, al tiempo que reduce los costes de operación y sostenimiento /../. Las acciones de planificación contemplarán que los procesos de desactivación y cierre finalizarán no más tarde del 31.07.99.